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海域使用权评估对象应该是一种“权益性资产”。
这个对象有几个与其他资产不同的地方：
一是，它跟土地使用权的性质一样，只是一定期间内的使用权，所以，有关权益问题的年限就非常有必要搞清的，这种权益未必与企业经营期限相对应，但可能与权利的承继有关联，有必要阅读权益文件和相关的协议；
二是，清查比较困难，也就是范围方面的，但这个问题可以以权证为依据；
三是，海域使用权目前估计交易或购买的案例不多，运用市场比较法评估可能不合适，同时，其达到什么样的开发程度可能也缺少依据性的东西，不象土地使用权还有“五通一平”或“七通一平”之类的标准，所以，很难采用类似土地使用权评估中的基准地价法评估。
关于评估方法的选择问题：
海域使用权的基本估价方法通常可选择采用市场比较法、收益法、成本法、剩余法等。但必须考虑根据委估具体对象的权属特征、开发状况、资料取得等因素选择最适合的估算方法。
1、市场比较法是在同一市场条件下，根据替代原则，以条件类型或使用价值相同的士地交易实例与委估对象加以对照比较，在两者之间就影响该海域使用权的交易情况、期日、区域及个别因素等进行修正，求取委估使用权在评估基准日表现的价格的方法。但就委估对象而言，一是可能存在类似交易案例的缺乏或者面积等差异过大而缺乏可比性，二是可能存在较长时期的不可撤消的投资协议约定的交易制约影响以及海域使用权的面积、开发程度等因素的差异较大，修正的参数的准确确定有一定难度。我个人感觉，不适宜采用该种方法。
2、剩余法又称假设开发法，是将待估海域使用权及其范围内的相关设施销售价格减去正常建造成本、正常利润、税金、利息，从而求得该海域使用权价格的一种估价方法。我们知道，减号后面的可能比较容易取得，但海域使用权及其上的相关设施的销售价格可能还存在着市场信息不足的情况，所以这种方法可能难以适用。
3、成本法的基本思路是把对海域使用权的所有投资，包括最初的取得费和相关围拦等基本设施开发费两大部分，作为“基本成本”，加上基本投资所应产生的相应利润和利息，组成海域使用权价格的基础部分。并同时根据国家对海域所有权在经济上得到实现的需要，加上海域所有权应得收益（即类似于出让金），从而求得海域使用权价格。但该种方法使用的前提条件――类似的出让金之类的资料可能未必能够取得。
4、收益法，也称权益性资产的资本化法，是在考虑海域使用权还原率的基础上，将其在将来所能产生之期待纯收益折算现值的总和，求取委估资产价格的方法。根据本次委估目的看，在长期合同约定下，其产生的收益与业务经营内容和相关产品市场存在着对应的关系，其收益的估算需要考虑一些假设的条件，比如相关产品的市场走势，经营实体本身经营方向和战略上不存在重大变动、不可抗力的因素（如海蟹、台风等）、从该评估目的为银行抵押贷款之目的看，银行最为关注的恐怕是收益及其归还能力吧。在具体评估中，可能还需要借助有关海产品养殖专家的意见，比如了解每公顷的投入产出经验性数据，海产品的苗和产品的价格等等，另外，在折现率的选取方面，可能需要针对其较大的风险因素而作就高不就低考虑。